Argonne переписала генетический анализ под GPU: 2 068 признаков у 635 969 ветеранов

Команда Аргоннской национальной лаборатории переписала пакет SAIGE под GPU (SAIGE-GPU), сократив анализ со 481 000 CPU-часов. На данных программы Million Veteran Program изучены 2 068 признаков у 635 969 ветеранов и найдено 13 672 связанных с болезнями участка генома, из них около 1 600 — только за счёт неевропейского происхождения части участников.

• SAIGE-GPU заменил расчёт на CPU, занявший около 481 000 ядро-часов
• Проанализированы 2 068 признаков у 635 969 ветеранов
• Найдено 13 672 участка генома, связанных с заболеваниями
• Около 1 600 ассоциаций выявлены только у неевропейских групп