BBERT распознаёт бактериальную ДНК в коротких фрагментах почвы

Учёные Еврейского университета в Иерусалиме и партнёры представили BBERT — ИИ-модель на базе BERT, определяющую бактериальную ДНК во фрагментах от 100 оснований. Точность классификации около 90%, кодирующих участков — 88%, рамок считывания — 96%; фильтрация сократила сборку с 66 до 25 часов на датасет.

• Точность распознавания бактериальной ДНК — около 90%
• Кодирующие фрагменты определяются с точностью 88%, рамки считывания — 96%
• Сборка ускорилась с 66 до 25 часов на датасет
• На клубеньках бобовых пик памяти упал с 188 до 82 ГБ