Nvidia и DeepMind открыли структуры белков 2800 вирусов через AlphaFold

Nvidia совместно с Google DeepMind и партнёрами выпустила открытый датасет предсказанных 3D-структур белковых комплексов более 2800 вирусов, включая опасные для человека. Данные доступны через Pandemic Preparedness Portal базы AlphaFold, также опубликован пайплайн BioNeMo Structure Prediction Pipeline.

• Датасет охватывает белки более 2800 вирусов, включая патогены человека
• Около 30% предсказанных взаимодействий белков отсутствуют в Protein Data Bank
• Структуры предсказаны AlphaFold2 с GPU-ускорением через BioNeMo
• Данные бесплатны в AlphaFold Database Pandemic Preparedness Portal